A partir del primer semestre del 2002 la revista presentó una nueva imagen. La portada ahora exhibió una fotografía del Cerro Santa Lucía, diseñada por Claudia Tapia Roi. Desde esa fecha, además, las autoridades y el consejo editorial permanecieron más estables. Como directora de la DIBAM, fue designada Clara Budnik; como director responsable, Alfonso Calderón, secretarios de redacción, Pedro Pablo Zegers y Tomás Harris Espinosa, secretaria de redacción adjunta, Daniela Schütte González. En cuanto al consejo editorial, lo integraron: Alfonso Calderón, Gonzalo Catalán Bertoni, Marcos García de la Huerta Izquierdo, José Ricardo Morales Malva, Pedro Lastra Salazar, Soledad Falabella Luco, Carlos Ossandón Bujlevic y Manuel Vicuña Urrutia. Si bien el criterio editorial instaurado por Sergio Villalobos se siguió respetando, hubo pequeñas innovaciones. Por ejemplo, los artículos ya no se dividieron en sección humanidades y ciencias sociales sino que se reunieron en un gran espacio Humanidades, donde se incluyeron ensayos de literatura, estudios culturales y de género, historia, sociología y política. Además la sección comentario de libros pasó a llamarse Reseñas.

A lo largo de los años, Mapocho ha conseguido su objetivo, encontrar ese "espacio social, el que ocupa el lector, ese que aspira a ver el mundo como un lugar inteligible, en consonancia con los tiempos en que se vive" (Alfonso Calderón, Mapocho. Revista de Humanidades y Ciencias Sociales, ( 30): 302, Segundo semestre, 1991)